Criar um único arquivo com que contenha todos os shapefiles dos seus projetos (e todas suas extensões: dbf, shx, prj…) pode ser bastante útil, concorda?

O formato geopackage (.gpkg) permite que você crie pacotes dentro do QGIS, o que pode te ajudar bastante por conta de sua funcionalidade.

Te ensino nesse vídeo como criar um geopackage para organizar e facilitar a visualização das camadas nos seus projetos.